本书以其独特风格的两条平行线展开。一条平行线是少年“田村卡夫卡”，为了挣脱“你要亲手杀死父亲，与母亲乱伦”的诅咒，离开家乡投入成人世界。此后父亲在家被杀，他却疑心自己是在睡梦中杀父。他在一座旧图书馆遇到一位50岁的优雅女性，梦中却与这位女性的少女形象交合，而这位女性又可能是他的生母。 一条平行线是一名失忆老人中田，因为一桩离奇的杀人事件走上逃亡之路，在汽车司机星野的帮助下恢复了遥远的战争记忆。

斯普特尼克是历史上第一颗进入地球轨道的人造卫星的名字，意思是“旅伴”。 沉迷于写作的少女堇和她的音乐同道、年长17岁的中年美女敏心心相惜。堇接受了敏的聘请，协助打理敏的事务所，并作为秘书与敏同赴欧洲旅行。然而在希腊小岛上，堇却神秘地失踪了，因为她发现敏只是一个躯壳，其灵魂已在一个惊险之夜失去。她们的关系如同人造卫星般“偶然相遇，失之交臂，永离永别”。

六具白骨摆列在一间亦真亦幻的死亡之屋里。“我”的老朋友“鼠”已经死于寻羊冒险。“我”好不容易找到了投缘的老同学五反田，可这位被演艺圈包装得精神分裂的电影明星却接连勒死两名高级应召女郎，自己也驾着“玛莎拉蒂”葬身大海。孤独的女孩“雪”和她孤傲的母亲“雨”虽然还能在这疯狂世界上勉强生存，可“雨”的守护神笛克却也躲不过一场莫名的车祸。 度过了一段死亡陪伴的惊魂日子，“我”终于在宾馆女服务员由美吉那里找到安全感，也有了在安静城市过安静生活的具体计划。可是，那第六具白骨到底意味着谁呢？“我”依然逃不出死亡之屋。

37岁的“我”初君在东京市区拥有两家生意兴隆的酒吧，还有娇美的妻子和两个可爱的女儿，称得上家庭事业双丰收的成功人士，然而内心总是感到空虚。初君的过去由他和岛本、泉、泉的表姐三个女子的情感纠缠组成。心中的缺憾似乎唯有小学时结识并滋生朦胧情感的女友岛本才能弥补。 25年后，岛本突然出现，二人重燃爱火，可岛本不愿吐露自己的经历和现在的身份，只希望初君什么都别问只管接受眼前的自己，只把她当成小学时那个热爱古典乐的女孩就好。初君接受了这些苛刻条件，陪同岛本到东京河边洒下婴儿骨灰后，两人在箱根别墅度过了难忘的一夜。次日，她一去杳然，再无踪迹可寻。

辞去法律事务会所工作的冈田亨和身为杂志社编辑的妻子久美子过着平静的生活。久美子受到其兄长也是众议员的黑暗势力代表人物绵谷升的胁迫突然失踪。 之后，冈田身边出现许多怪人：女巫师、“意识娼妇”、失手导致男友车祸死亡的少女、老兵等，同时也发生许多怪事。 冈田下到一口深井里冥思苦想后出井，在一对怪异的母子“肉豆蔻”和“肉桂”的帮助下向绵谷升发起挑战，在虚幻中将其击伤，久美子又在现实中将其杀死。